עבור כל מסד נתונים, עליך להגדיר את סיסמאות הבסיס או sa למשהו שאינו ברירת המחדל, אלא אם כן אתה רוצה להיפרץ. עבור mysql, משתמש מנהל המערכת נקרא root. תשתמש בכלי השירות mysqladmin משורת פקודה כדי להגדיר את הסיסמה החדשה. שימו לב שיש שתי פקודות להפעלה.
תחביר:
סיסמת השורש mysqladmin -u "newpassword"
mysqladmin -u root -h סיסמת מארח "newpassword"
דוגמא:
סיסמת שורש mysqladmin -u ws8dr8as3
mysqladmin -u root -h סיסמת localhost ws8dr8as3
כמו כן, תרצה להפעיל מחדש את שרת מסד הנתונים לאחר הפעלת פקודה זו
sudo /etc/init.d/mysql הפעלה מחדש